Правовые основы сметно-бюджетного финансирования + задача

Порядок утверждения сметы доходов и расходов содержится в ст. 221 Бюджетного кодекса РФ: “В течение 10 дней со дня получения уведомления о бюджетных ассигнованиях бюджетное учреждение обязано составить и представить на утверждение вышестоящего распорядителя бюджетных средств смету доходов и расходов по установленной форме. В течение пяти дней со дня представления указанной сметы распорядитель бюджетных средств утверждает эту смету.
Смета доходов и расходов бюджетного учреждения, являющегося главным распорядителем бюджетных средств, утверждается руководителем главного распорядителя бюджетных средств.
Смета доходов и расходов бюджетного учреждения в течение одного рабочего дня со дня ее утверждения передается бюджетным учреждением в орган, исполняющий бюджет.”
Методология составления и утверждения смет расходов учреждений, состоящих на бюджетах всех уровней бюджетной системы РФ, устанавливается Минфином РФ, как федеральным органом исполнительной власти, обеспечивающим проведение единой финансовой, бюджетной, налоговой и валютной политики в РФ (в соответствии с постановлением Правительства РФ от 6.03.1998 г.№ 273 “Об утверждении Положения о министерстве финансов РФ”).
Задача
АО “Феникс” обратилось в арбитражный суд с иском о возврате из бюджета описанных в бесспорном порядке недоимок по НДС. Оспаривая действия налоговой инспекции АО сослалось на то, что соответствующие суммы налоговых платежей были уже перечислены им самостоятельно в бюджет ранее.
Дайте юридическую оценку всех возможных вариантов разрешения указанной ситуации.